Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx5Q9D8U8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms