Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms