Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2v1Q9CZY3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2v1Q9CZY3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2v1Q9CZY3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms