Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd2Q9CZB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thumpd2Q9CZB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms