Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufaf1Q9CWX2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufaf1Q9CWX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf1Q9CWX2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf1Q9CWX2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf1Q9CWX2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf1Q9CWX2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf1Q9CWX2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf1Q9CWX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms