Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Nicn1Q9CQM0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Nicn1Q9CQM0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Nicn1Q9CQM0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Nicn1Q9CQM0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nicn1Q9CQM0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nicn1Q9CQM0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms