Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd2Q9CQ48 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms