Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl22Q99JN2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl22Q99JN2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl22Q99JN2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms