Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn1Q922Y1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn1Q922Y1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn1Q922Y1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn1Q922Y1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn1Q922Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn1Q922Y1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn1Q922Y1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms