Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atl3Q91YH5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atl3Q91YH5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atl3Q91YH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms