Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy2Q8R4C2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy2Q8R4C2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy2Q8R4C2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms