Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paf1Q8K2T8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms