Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CopaQ8CIE6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CopaQ8CIE6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CopaQ8CIE6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CopaQ8CIE6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms