Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brf1Q8CFK2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brf1Q8CFK2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brf1Q8CFK2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms