Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm9955Q8CEJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm9955Q8CEJ8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm9955Q8CEJ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm9955Q8CEJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm9955Q8CEJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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