Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl11Q8CE33 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl11Q8CE33 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl11Q8CE33 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms