Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc17Q8CE13 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc17Q8CE13 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms