Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa8Q8CC88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa8Q8CC88 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms