Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4aQ8C9S8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4aQ8C9S8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms