Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc113Q8C5T8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc113Q8C5T8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms