Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg16l1Q8C0J2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg16l1Q8C0J2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms