Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rd3Q8BRE0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3Q8BRE0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms