Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQC3

Igdcc3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc3Q8BQC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igdcc3Q8BQC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Igdcc3Q8BQC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Igdcc3Q8BQC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms