Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr5Q80US4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr5Q80US4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms