Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLNKQ7Z7G1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms