Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfrkbQ6PIJ4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfrkbQ6PIJ4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms