Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a3Q6PIC6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a3Q6PIC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a3Q6PIC6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms