Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl2Q6PA06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl2Q6PA06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl2Q6PA06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms