Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Surf4Q64310 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Surf4Q64310 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms