Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpaQ62189 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SnrpaQ62189 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpaQ62189 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpaQ62189 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpaQ62189 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpaQ62189 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms