Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hif1aQ61221 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif1aQ61221 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms