Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata6Q61169 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms