Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan4Q5SZT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zkscan4Q5SZT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan4Q5SZT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms