Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf3Q5HZG4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf3Q5HZG4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms