Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ScimpQ3UU41 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScimpQ3UU41 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms