Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skap2Q3UND0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap2Q3UND0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms