Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne9Q1RLL3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cpne9Q1RLL3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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