Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r181Q0P547 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r181Q0P547 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms