Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NrepQ07475 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NrepQ07475 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NrepQ07475 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms