Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Thbs3Q05895 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms