Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Emx2Q04744 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms