Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb4Q02738 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb4Q02738 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms