Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mc1rQ01727 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc1rQ01727 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms