Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb1Q00420 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb1Q00420 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb1Q00420 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms