Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn1bP97952 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scn1bP97952 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms