Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd1P97443 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd1P97443 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd1P97443 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms