Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx3P81067 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx3P81067 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx3P81067 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx3P81067 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx3P81067 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx3P81067 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx3P81067 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx3P81067 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx3P81067 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx3P81067 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx3P81067 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx3P81067 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx3P81067 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx3P81067 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms