Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElobP62869 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ElobP62869 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ElobP62869 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ElobP62869 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElobP62869 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElobP62869 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElobP62869 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElobP62869 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElobP62869 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElobP62869 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElobP62869 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElobP62869 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElobP62869 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElobP62869 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ElobP62869 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ElobP62869 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ElobP62869 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ElobP62869 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ElobP62869 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ElobP62869 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ElobP62869 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ElobP62869 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ElobP62869 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ElobP62869 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ElobP62869 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ElobP62869 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ElobP62869 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ElobP62869 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ElobP62869 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ElobP62869 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ElobP62869 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ElobP62869 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ElobP62869 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ElobP62869 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ElobP62869 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ElobP62869 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ElobP62869 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ElobP62869 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ElobP62869 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ElobP62869 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms