Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CebpaP53566 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CebpaP53566 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CebpaP53566 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CebpaP53566 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpaP53566 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CebpaP53566 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms