Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Epb41l4aP52963 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41l4aP52963 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41l4aP52963 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms